Génome sans lacune du grand croaker jaune mâle publié

Des chercheurs ont publié un assemblage complet du génome d'un grand croaker jaune mâle (Larimichthys crocea), aidant l'aquaculture et les études sur la détermi

Gap-free genome of male large yellow croaker published

Image: nature.com

Une nouvelle étude a rapporté le premier assemblage du génome sans lacune de type télomère-à-télomère (T2T) pour un grand croaker jaune mâle (Larimichthys crocea), un poisson marin commercialement important en Chine. La recherche fournit un paysage génomique complet, comblant les lacunes qui étaient auparavant non résolues dans le génome de référence.

Le génome assemblé couvre tous les chromosomes avec une grande précision, permettant une analyse détaillée des régions de détermination du sexe et des séquences répétitives. Cette ressource devrait faciliter l'amélioration génétique et les programmes de sélection pour cette espèce, qui est un produit majeur de l'aquaculture en Chine.

L'étude a été publiée dans la revue Scientific Data le 15 août 2026. Les auteurs ont utilisé des technologies de séquençage avancées, notamment PacBio HiFi et Oxford Nanopore ultra-longues lectures, pour réaliser l'assemblage sans lacune.

Ce travail représente une étape importante dans la génomique des poissons, fournissant une référence précieuse pour les études de génomique comparative et évolutive chez les téléostéens.

❓ Frequently Asked Questions

What is a telomere-to-telomere (T2T) genome assembly?

A T2T assembly is a complete genome sequence from one end (telomere) to the other for every chromosome, with no gaps. It provides the most accurate and complete reference for genetic studies.

Why is the large yellow croaker important?

The large yellow croaker is one of the most important marine fish species for aquaculture in China, with high economic value. A complete genome helps improve breeding and disease resistance.

What technologies were used for this genome assembly?

The researchers used PacBio HiFi and Oxford Nanopore ultra-long reads, which are advanced sequencing technologies that produce long, accurate reads essential for gap-free assemblies.

📰 Source:
nature.com →
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